分公司的发票抬头应当在分公司入账核算，而不是把分公司的发票抬头在总公司入账核算的。分公司的发票抬头是不能在总公司入账核算的。确定取得的发票在哪个主体（是分公司还是总公司）核算，就是根据取得的发票抬头来确定的。